心灵部队和克拉克总统的政府发现了埋藏(cáng )在地球太(tài )阳系中的暗影飞船，并开始利用这些飞船(chuán )的先进技术。克拉克政府的排外主义和极权主义日益盛行，并以军事事件为借口宣布戒严。这引发了火星的独立战争，而火星长期以来与地球的政治关系一(yī )直紧张。巴比伦5号也宣(xuān )布脱离地球独立，其他几个地(dì )球联盟的外围殖民地也宣布独(dú )立。作为回应，地球联(lián )盟试图用武力夺回巴比伦5号(hào )，但在与空间站结盟对抗日益增长的暗影威胁的明巴利人的(de )帮助下，这次进攻被击退。