二十世纪初(chū )的日本太正时代，自明治维新以来的文明开化已进行了五十余年。　　随着西洋文化和日本传统文化的交(jiāo )汇融合，帝都·东京逐渐成为现代化建筑鳞(lín )次栉比，蒸汽铁道、地下铁道纵横交错，马车、人力车、蒸汽车(chē )川流不息的(de )繁华都市(shì )。然而，这也(yě )是一座有着怪物和咒术等非现实存在的魔幻都市。　　为了对抗从地底出现的强大魔物“降(jiàng )魔”，陆军成立(lì )了由将校中的灵能者组成的特殊部(bù )队——对降魔部队，成员即“二刀二剑”的4位继承者：米田一基，持有 “神刀·灭却”；山崎真之介，持有“光刀·无形”；藤枝菖蒲，持有“神剑·白羽鸟”；真宫寺一马，持有(yǒu )“灵剑·荒鹰”。四人仅凭自己的血肉之躯和手(shǒu )中的神剑与魔物(wù )作战，史称“降魔战争”。激战的(de )结果，陷入绝境的对降魔部队被迫使(shǐ )出最后的手段——利用“魔神器”发动“破邪之血”。魔神器即日本上古时代流传下来的三种祭器：剑、珠、玉，可以成为魔力的增幅器。继承真(zhēn )宫寺家“破邪之血”的一马，以自己的生命为代价用魔神器将降魔们封印，而山崎真之介(jiè )也在此战中失踪……　　太正十一年，以妖僧天海为首的邪恶组织“黑之巢会”蠢蠢欲动。仇(chóu )视近代文明的天海为了复辟德川幕府的统治，率领手下的死天王葵叉丹、弥勒、修罗、罗刹，操纵着利用古代咒法生出的魔物——魔操机兵(bīng )在(zài )帝(dì )都展开了破坏活动。为了对抗这新的威胁、守护帝都和民众，在花小路伯爵的大力支持(chí )下，新的政府直属对降魔组织——帝国华击团（简称“帝击”）·花组成立了。在米田一基、藤枝菖蒲的领导下，花组集结了6名具备高灵力的少女：真宫寺一马的女儿、灵剑·荒鹰的继承者真宫寺樱；神崎财阀总帅忠义的孙女、精通神崎风尘流长刀术的神崎堇；俄(é )国革命的勇士、曾有“食火鸟”之称的玛丽亚·橘；自幼(yòu )就因超常的灵力被与世隔绝、年仅10岁的法国贵(guì )族千金爱丽丝；在辛亥革命的战乱中失去亲人、精通机械的(de )中国少女李红兰；以及桐岛流空手的正统传人、身高近 2米的桐岛神奈。同时，基于山(shān )崎真之介留下的设计，由神崎重工完成了(le )对降魔用灵(líng )子(zǐ )甲胄“光武”。以银座大(dà )帝国剧场为基地、平日以歌剧团面目出现来掩人耳目的花组，在魔物出现时就会变为守护(hù )帝都的战士，驾驶光武与敌人作战。　　太正十二年春，苦于战力及协作性不足的花组来了(le )一位新(xīn )队长——海军少尉大(dà )神一郎，《樱(yīng )花大战》的故事也就从这里开始了……