《游戏王-怪兽之决斗》改编自漫画(huà )《游戏王》，于2000-2004年之间在东京电视台播出。故事以漫画剧情为主，但因为中途漫(màn )画故事情节进度跟不上，故加插大量漫画没有的剧情和人物。此举为脱(tuō )离“原作”独立创作故事奠定下基础。　　决斗者王国篇　　一卷神秘(mì )的录像带，千年神器中千年眼的拥有者，贝卡斯·J·克罗佛多在录像带中使用黑暗决斗向武藤游戏挑战，但武藤游戏(xì )却因为时间终止而败北，武藤双六的灵魂也因此被千年眼的力量封印在灵魂封(fēng )印卡中(zhōng )（漫画版为贝卡斯寄给游戏的录像带(dài )），武藤游戏为了救回灵魂被囚禁的爷爷，与伙伴们前往决斗者王国找贝卡斯决斗，与互信的伙伴们以及心中(zhōng )的另一(yī )个自己(jǐ )并(bìng )肩作(zuò )战。　　战斗城市前篇　　决斗(dòu )者王国一战结束，武(wǔ )藤游戏的知名度瞬(shùn )间上升，神秘的埃及石板来到日本展览，牵扯出(chū )千年神器的秘(mì )密、三千年前的战斗、三张神之卡，还有隐藏在千年(nián )积木中的无名法老王的记忆，海马濑人在一个机缘下得到了神之卡(kǎ )的(de )其中一张：欧贝利斯克的巨神兵，而他为了得(dé )到剩余的二张神之(zhī )卡，在童实野市举办了战斗城市大赛，并且以赌牌当作规则，同时新的次世代决斗盘也跟着亮相，而武藤游戏为了寻找心中的另一个自己的记忆，也就是无名法老(lǎo )王的记忆，必须搜集三张神之卡，也参加了这场大赛，各路好手(shǒu )为(wéi )了搜集六张拼图卡，得到最后的参赛权，纷(fēn )纷展开决斗；神秘的古鲁斯集团派出的蕾雅卡猎人(rén )也参杂其中。　　乃亚篇（动画原创）　　战斗飞行船行驶人工岛的途中，飞行船系统却遭(zāo )受到外来的入侵改写了系统，因而改变了(le )航线，阻挡在武藤游戏等人面前的这个巨大(dà )机动要塞究竟是什么？而又出现了神秘的人，自称是“五巨头”，他们还要武藤游戏等(děng )人的身体，一场赌上各人性命(mìng )的(de )决斗，而他们又发现五大老的头，叫乃亚的小孩，却是刚三郎（海马的养父）的儿子！！一场大战即将(jiāng )展开。　　战斗城市后篇　　战斗(dòu )城市最终决战开(kāi )始，每个决斗者都各自有战斗的理由，城之内为了成为真正的决斗者、救出(chū )被马利克进行黑暗(àn )游戏惩罚(fá )的孔雀舞，海马为了与宿敌游戏决斗、为了铲除可恶的古鲁斯首脑并得到太阳神、为了完成海马乐园的梦想，游戏为了实现与城之内(nèi )的诺言、与海马宿命的对决、救出被暗马(mǎ )利克施予黑暗游戏惩罚的(de )人(rén )们、更为了自己(jǐ )遗失的记忆，他向马利克宣战(zhàn )。　　多玛篇(piān )（动画原创）　　战斗城市结束后，武藤游戏遭受到了不知名力量的阻挡，而三张神之卡也被名为多玛三剑客的人抢走，这个神秘的(de )多玛组织抢走神之卡的目的究竟是什么，神秘的卡片——“奥利哈刚的结(jié )界”拥有的黑暗能量，又会带给使用这张卡片(piàn )的人什么样的改变；黑魔导女孩从精灵的世(shì )界降临，向武藤游戏请求援助，人类世界与精灵世界的命运会如何，无名的传说之龙又会怎么样(yàng )的帮助游(yóu )戏等人。　　海马集团大赛篇（动画原创）　　多玛事件结束后，武藤游戏和同伴因没(méi )钱回不到日本(běn )，无奈之下请求海马公司，却阴差阳错的参加(jiā )了海马集团为维护声誉的比赛。全世界的决斗者聚集在这，一场别开生面的比赛就此(cǐ )展开。　　王之记(jì )忆篇　　为了寻找寄宿在千年积木中无名法老王灵魂的真实姓名与记忆，武藤游戏与(yǔ )朋友们踏上了埃及之旅，在(zài )记忆石板的背后，解(jiě )开了无名法老王的过去记忆(yì )，暗貘良也趁此(cǐ )时蠢蠢欲动，利用了千年智慧轮的黑暗力量，在千年积木内进行了一场黑暗RPG，这场黑暗RPG游(yóu )戏中，直接(jiē )以无名法老王的记忆当作背景，暗游戏必须从这场黑暗游戏中找回自己的真实姓名、得知自己的过去，并且打败大邪神佐克，再一次封印，否(fǒu )则大邪神佐克也会在现实(shí )世界中(zhōng )复(fù )活。　　共有224集。