《游戏王-怪兽之决斗》改编自漫画《游戏王》，于2000-2004年(nián )之间在东京电视台播出。故事以漫画剧(jù )情为主(zhǔ )，但因(yīn )为(wéi )中途漫画故事情节进度跟不上，故加插大量漫画没有的剧情和人物。此举为脱离“原作”独立创作故事奠定(dìng )下基础。　　决斗者王国篇　　一卷神秘的录像带，千年神器中千年眼的拥有者，贝(bèi )卡斯·J·克(kè )罗佛多在录像带中使用黑暗决斗向武(wǔ )藤游戏挑战，但武藤游戏却因为时间终止而败北，武藤双六的灵(líng )魂也因此被千年眼的力量封印在灵魂封印卡中（漫画版(bǎn )为贝卡斯寄给游戏的录像带），武藤游戏为了救回灵魂被囚禁的爷爷，与伙伴们前往决斗者王国找贝卡斯决斗(dòu )，与互信的伙伴们以及心中的另一个自己并肩作战。　　战斗城市前篇　　决斗者王国一战结束，武藤游戏(xì )的知名度瞬间上升，神秘的(de )埃及石板来到日本展览，牵扯出千年神器的秘密、三千年前的战斗、三张神之卡，还有隐藏在千年积木中的无名法老王的记忆，海马濑人在一个机缘下得到了神之卡的其中一张：欧贝利斯克的巨神兵，而他为了得到剩余(yú )的二张神之卡，在童实野市举办了战斗城市大赛，并且以赌牌当作规则(zé )，同时新的次世代决斗盘也跟着亮相，而武藤游戏为了寻找心中的另一个自己的记忆，也就是无名法老王的记(jì )忆，必(bì )须搜集三张神之卡，也参加(jiā )了这场大赛，各路好(hǎo )手为了搜集(jí )六张拼图卡，得到最(zuì )后的参赛权，纷纷展开决斗；神秘(mì )的古鲁(lǔ )斯集团派(pài )出的蕾雅卡猎人也参杂其中。　　乃亚篇(piān )（动画原创）　　战斗飞行船行驶人(rén )工岛的途中，飞行船系统却遭受到外(wài )来的入侵改写了系统，因而改变了航线，阻挡在(zài )武藤游戏等人面前的这个巨大机动要塞究竟是(shì )什么？而又出现了(le )神秘的人，自称是“五巨头”，他们还要武藤游戏等人的身体(tǐ )，一场赌上各人性命的决(jué )斗，而他(tā )们又发现五大老的头，叫乃亚的小孩，却是刚三郎（海马的养父）的儿子！！一场大战即将展开。　　战斗城市后篇　　战斗城市(shì )最终决战开始，每个决斗(dòu )者(zhě )都各自有战斗的理由，城之内为(wéi )了成为真正的决斗者、救出被马利克进行黑暗游戏惩罚的孔雀舞，海马为了与宿敌游戏决斗、为了铲除可恶(è )的古鲁斯首脑并得到太阳神、为(wéi )了完成海马乐园的梦想，游戏为了实现与城之内的诺言、与海马宿命的对决、救出被暗马利克施予黑暗游戏惩罚的人们、更为了自己遗失的记忆，他向马利(lì )克宣战。　　多玛篇（动画原创）　　战斗城市结束后，武藤游戏遭受到了不知名力量的阻挡，而三张神之卡也被名为多玛三剑客的人抢走，这个神秘的多玛组织抢走(zǒu )神之卡的目的究竟是什么，神秘的卡片——“奥利哈刚的结界”拥有的黑暗能量，又会带给使用(yòng )这(zhè )张卡片的人什么样的(de )改变；黑魔导女孩从精灵的世界降临，向武藤游戏请求援助，人类世界与精灵世界的命运会如何，无名的传说之龙又会怎么样的帮助游戏(xì )等人。　　海马集团大赛篇（动画原创）　　多玛事件结束后，武藤游戏和同伴因没钱回不到日本，无奈之下请求海(hǎi )马(mǎ )公司，却(què )阴差阳错的参加了海马集团为维(wéi )护声誉的比赛。全(quán )世(shì )界的决斗者聚集在这，一场别开生面的比赛就此展开。　　王之记忆(yì )篇　　为了寻找寄宿在千年(nián )积木中无名法老王灵魂的真实姓名与记忆，武藤游戏与朋友们踏上了埃及之旅，在记忆石板的背后，解开(kāi )了无名法(fǎ )老王的过去记忆，暗貘良(liáng )也(yě )趁此时蠢蠢欲动，利用了千年智慧轮的黑暗力量，在千年积木内进行了一场黑暗(àn )RPG，这场黑暗RPG游戏中，直接以无名法老王的(de )记忆当作背景，暗(àn )游戏必须从这场(chǎng )黑暗(àn )游戏中找回自己的真实姓名、得知自己的过去，并且打败大邪神佐克，再一次封(fēng )印，否(fǒu )则大邪神佐克也会在现实世界中复活。　　共有224集。