《游戏王-怪兽之决斗》改编自漫画《游戏王(wáng )》，于2000-2004年之间在东京电视台播出。故事以漫画剧情为主，但因为中途漫画故事情节进度跟不上，故(gù )加插大量漫(màn )画没(méi )有的剧情和人物。此举为脱(tuō )离“原(yuán )作”独立创作故事奠定下基础。　　决斗者王国篇　　一卷(juàn )神秘的录像带，千年神器中千年眼的拥有者，贝卡斯·J·克罗佛多在(zài )录像带中使用黑暗决斗向武藤游戏挑战，但武藤游戏却因为时间终止而败北，武藤双六的(de )灵魂也因此被千年眼的力量封印在灵魂封(fēng )印卡中（漫画版为贝卡斯寄给游戏的录像带），武藤游戏为了救回灵魂被囚禁的爷爷，与伙伴们前往决斗者王国找贝卡斯决斗，与互信的伙伴们以及心中的另(lìng )一个自己并肩作战。　　战斗城市前篇　　决斗者王国(guó )一战结束，武藤游戏的知名度瞬间上升，神秘的(de )埃及石板来(lái )到日本展览，牵扯出千年神器的秘密、三千年前的战斗、三张神之卡，还有隐藏在千年积木中的无名法老王的记忆，海马濑人在一个机缘下得到了神之卡的(de )其(qí )中一张：欧贝利斯克的巨神兵，而他为了得到剩余的二张(zhāng )神之卡，在(zài )童实野市举办了(le )战斗城市大(dà )赛，并且以赌牌当作规则，同时新的次世代决斗盘也跟着亮相，而武藤游戏为了寻找心中的另一个自己的记忆，也就是无名法(fǎ )老王的记忆，必须搜集三张神(shén )之卡，也参加了这场大赛，各路好手为了搜集六张拼图卡，得到最后的参赛权，纷纷展开决斗；神秘的古鲁斯集团(tuán )派出的蕾雅卡猎人也参杂其中。　　乃(nǎi )亚篇（动画原创(chuàng )）　　战斗飞行船行驶(shǐ )人工岛的(de )途中，飞行船系统却遭受到外来的入侵改写了系统，因而改变了(le )航线，阻挡在武藤游戏等人面前的这个巨(jù )大机动要塞究竟是什么？而又出现了神秘的人，自称是“五巨头”，他们还要武(wǔ )藤游戏等人的身体，一场赌上各人性命的决斗，而他们又发现五大老的头，叫乃亚的小孩，却是刚三郎（海马的养父）的儿子！！一场大战即将(jiāng )展开(kāi )。　　战斗城(chéng )市后篇　　战斗(dòu )城市最终决战开始，每个决斗者都各自有战斗的理由，城之内为了成为真正的决斗者、救出被马利克进行黑暗游戏惩罚的孔雀舞，海马为了与宿敌游戏决(jué )斗、为了铲除可(kě )恶的古鲁斯(sī )首脑并得到太阳神(shén )、为(wéi )了完成海马乐园(yuán )的梦想(xiǎng )，游戏为了实现与城之内的诺言、与海马宿命的对(duì )决、救出被暗马利(lì )克施予黑暗游戏惩罚的人们、更为了自己遗失的记忆，他向马利克宣战。　　多玛篇（动画原创）　　战斗城市结束后，武藤游戏遭受到了不知名力量的阻挡，而三张神(shén )之卡也被名为多玛三剑客的人抢走，这个神秘的多玛组织(zhī )抢走神之卡的目的究竟是什么，神(shén )秘的卡片——“奥利(lì )哈刚的结界”拥有的黑暗能量，又会(huì )带给使用这张卡片的人(rén )什么样的改变；黑魔导女孩从精灵的世界降临，向武藤游戏请求援助，人类世界与(yǔ )精灵世(shì )界的命运会如何，无名的传说之龙又会怎么样的帮助游戏等人。　　海马集团大赛篇（动画原创）　　多玛事件结束后，武藤游戏和同伴因没钱回不到日本，无奈之下请求海马公司，却阴差阳错的参加了海马集团(tuán )为维(wéi )护声誉的比赛。全世界的(de )决斗者聚(jù )集在这，一场别开生面的比赛就此展开。　　王之记忆篇　　为了寻找寄宿在千年积木中无名法老王灵魂的真实姓名与(yǔ )记忆，武藤游戏与朋友们踏上了埃及之旅，在记忆石板的背后，解开了无名法老王的过去记忆，暗貘良也趁此时蠢蠢欲动，利用了千年智慧轮的黑暗力量，在千年积木内进行了一场黑暗RPG，这场黑暗RPG游戏中，直接以无(wú )名法老王的(de )记忆当作背景，暗游戏必须从这场(chǎng )黑暗游戏中找回自己的真实姓名、得知(zhī )自己的过去，并且打败大邪神佐克，再一次封印，否则大邪神佐克也会在现实世界中复活。　　共有224集。