《游戏王-怪兽之决斗》改编自漫(màn )画《游戏王》，于2000-2004年之(zhī )间在东京电视台播出。故事以漫画剧情为主，但因为中途漫画故事情节进度跟不上，故加插大量漫画(huà )没(méi )有的剧情和人(rén )物。此举为脱离“原作”独立创作故事奠定下基础。　　决斗者王国篇　　一卷神秘的录(lù )像带，千年神器中千年眼的拥有者，贝卡斯·J·克罗(luó )佛多在录像带中使(shǐ )用黑暗决斗向武(wǔ )藤游戏挑战，但武藤游戏却因为时间终止而败(bài )北，武藤双六的灵魂也因此被千年眼的力量封印在灵魂(hún )封印卡中（漫画版为贝卡斯寄给游戏的录像带），武(wǔ )藤游戏为了救回灵魂被囚禁的爷爷，与伙伴们前往决斗者王(wáng )国找贝卡斯决斗，与互信的伙伴们以及心中的另一个自己并(bìng )肩作战。　　战斗城市前篇　　决斗者王国一战结束，武藤游戏的知名度瞬间上升，神秘的埃及石板来到日本展览，牵扯出(chū )千年神器的秘密、三千年(nián )前的战斗、三张神之卡，还有隐藏在千年积木中的无名法老王的记忆，海马濑人(rén )在一个机缘下(xià )得到了神之卡的其中一张：欧贝利斯克的巨神兵，而他为了得到剩余的二(èr )张神之卡，在童实野市举办了战斗城市大赛，并且以赌牌当作规则，同时新的次世代决斗盘也跟着亮(liàng )相，而武(wǔ )藤游戏为了寻找心中的另一个自己的记忆，也就是(shì )无名法老王的记忆，必须搜集三张神之卡，也参加了这(zhè )场大赛，各路(lù )好手为了搜集六张拼图卡，得到最后的参(cān )赛权，纷纷展开决斗；神秘(mì )的古鲁斯集团派(pài )出的蕾雅卡猎人也(yě )参杂(zá )其中。　　乃亚篇（动画原创）　　战斗(dòu )飞行船行驶人工岛的途中，飞行船系统却遭受到外来的入侵改写了系统，因而改变了航线，阻挡(dǎng )在武藤游戏等人面前的这个巨大机动要塞究竟是什么？而又出现了神秘的人，自称是“五巨头”，他们还要武藤游戏等人的身体，一场赌上各人性命的决斗，而他们又发现五大老的头，叫乃(nǎi )亚的小孩，却是刚三郎（海马的养(yǎng )父）的儿子！！一场大战即将展开。　　战斗城市后篇　　战(zhàn )斗城市最终决战开(kāi )始，每个决斗者都各自有战斗的理由，城之内为了成为真正的决斗(dòu )者、救出被马利克进行黑暗游戏惩罚的孔雀舞，海马为了(le )与宿敌游戏决斗、为了铲除(chú )可恶的古鲁斯首脑并得到太(tài )阳神、为了完成海马乐园(yuán )的梦(mèng )想，游戏为了实现与城之内的诺言、与海(hǎi )马宿命的对决、救出被暗马利克施予黑暗游戏惩罚的(de )人们、更为了自己遗失的记(jì )忆，他向马利克宣战。　　多(duō )玛(mǎ )篇（动画原创）　　战斗城市结束后，武藤游戏遭受到了不知名力量的阻挡，而三张神之卡也被名为多玛三剑客的人抢走，这个神秘的多玛组织抢走神之卡的目的究竟是什么，神秘的卡片——“奥利哈刚的结界”拥有的黑暗能量，又会带给使用这张卡片的人什么样的改变；黑魔导女孩从精灵的世界降临，向武藤游戏请求援助，人类世界与精灵世界的命运会如何，无名的传说之龙又会怎么样的帮助游戏等人。　　海马集团(tuán )大赛篇（动画原创）　　多玛事件结束后，武藤游戏和同伴因没钱回不到日本，无奈之下请求海马公司，却阴差阳错的参加了(le )海马集团为维护声誉的比赛(sài )。全(quán )世界的决斗者聚集在这，一(yī )场别开生面(miàn )的比赛就此(cǐ )展开。　　王之记忆篇　　为了寻找寄(jì )宿在千年积木中无名法老王灵魂的真实姓名与记忆，武藤游戏(xì )与朋友们踏上了埃及之旅，在记忆石板的背后，解开了无名法老王的过去记忆，暗貘良也趁此时蠢蠢欲动，利用了千年智慧轮的(de )黑暗力量，在千年积木内进行了一场黑暗RPG，这场(chǎng )黑暗RPG游戏中，直接以无(wú )名法老王的记忆当作背景，暗游戏必须(xū )从这(zhè )场黑暗游戏中找回自己的真实姓名、得知自己的过去，并且打败大邪神佐克，再一次封印，否则大邪神佐克也会在现实世界中复活。　　共有224集。